Yii Framework

Файл лога на это не влияет.

Удалите /var/www/domains/runtime/logs/app.log
Запросите страничку один раз и посмотрите что там.

Уберите файлы .htaccess

service apache2 restart (или systemctl restart apache2)

А в $models точно не одна модель?

Смотрите логи.

Вы зачем Directory выкинули? <VirtualHost domains.it-service.tj:80> ServerName domains.it-service.tj ServerAlias domains.it-service.tj ServerAdmin webmaster@localhost DocumentRoot /var/www/domains/web ErrorLog ${APACHE_LOG_DIR}/error.log CustomLog ${APACHE_LOG_DIR}/access.log combined <Directory &qu...

А зачем вы передаете 0 вместо хэша пароля?

Зачем на VDS извращения для shared хостинга? https://github.com/yiisoft/yii2/blob/master/docs/guide/start-installation.md # Set document root to be "basic/web" DocumentRoot "path/to/basic/web" <Directory "path/to/basic/web"> # use mod_rewrite for pretty URL support Rewr...

А что вы хотите получить в итоге?
Роуты controller/action и module/controller/action работают и без правил.
Только надо запрашивать как /handbooks/contacts-type

Судя по миграции языка там нет $this->createTable(self::TABLE_NAME, [ 'id' => $this->primaryKey(), 'model' => $this->string(64)->notNull()->defaultValue(''), 'model_id' => $this->integer(), 'user_id' => $this->integer(), 'username' => $this->string(128), 'email' => $this->string(128), 'parent_id' =>...

Присвойте false после load()

Замените echo json_encode($data); на return json_encode($data);

Запоминайте, что отправили на фронт и проверяйте. Тут нет волшебного решения.

Проверить, есть ли фраза в базе.

Не надо дублировать информацию. Проверяйте у корневого элемента.

Flexbox
https://developer.mozilla.org/en-US/doc ... of_Flexbox